需要综合考虑以上因素，可以与不同的招标代理机构进行沟通，了解他们的服务范围、项目经验和价位，再结合具体的项目情况，比较不同机构的报价，最终选定合适的代理机构费用。
制定合理的建筑工程招标代理机构费用需要考虑以下几个因素:
1. 服务范围: 需要明确招标代理机构的具体服务范围，包括招标文件编制、招标公告发布、投标单位资格审核、投标报价分析等。根据服务范围的不同，费用也会有所差异。
2. 项目规模: 建筑工程的规模越大，需要的人力和资源投入也越多，因此费用相对较高。可以根据项目的具体规模和复杂程度来确定费用标准。
3. 经验和口碑: 招标代理机构的经验和口碑也会对费用产生影响。久经沙场、专业素质高的代理机构可能会收取相对较高的费用，但其服务质量和效果也更有保证。
4. 专业水平: 需要考虑招标代理机构的专业水平和技术实力。一些高水平的机构可能在服务质量上更有保障，因此相应的费用也会更高。
5. 业务量: 如果招标代理机构同时负责多个项目的招标工作，可能会给予一定的折扣或者优惠费用。所以可以根据业务量来考虑费用的合理性。
需要综合考虑以上因素，可以与不同的招标代理机构进行沟通，了解他们的服务范围、项目经验和价位，再结合具体的项目情况，比较不同机构的报价，最终选定合适的代理机构费用。同时，要注意合同中的条款明确费用的支付方式和周期，并确保费用与服务的成本合理相符。